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NFS 儲存解決方案與最新的 Dell EMC 儲存 -- 效能結果

概要: HPC 高效能運算, HPC 和人工智慧創新實驗室, HPC 儲存, HPC 儲存解決方案, NFS 儲存解決方案, XFS 儲存, NFS 儲存, 儲存解決方案, RHEL7, RHEL7.5, IB EDR 儲存, NSS, NSS-HA, NSS7.3, NSS7.3-HA, IOZone, MDTest

この記事は次に適用されます: この記事は次には適用されません: この記事は、特定の製品に関連付けられていません。 すべての製品パージョンがこの記事に記載されているわけではありません。

現象

作者:Mario Gallegos 和 Xin Chen,HPC 與 AI 創新實驗室,2018 年 10 月

解決方法

概觀

最新的 HPC NFS 儲存 (NSS) 高可用性 (NSS-HA 解決方案) 專用 Dell EMC Ready Solution 版本將為 NSS7.3-HA,並計畫在本月晚些時候推出。
此版本的 NSS 結合了全新 Dell EMC PowerVault ME4084 儲存陣列 和 Red Hat Enterprise Linux 7.5,並繼續使用 Intel Xeon 可擴充處理器系列 CPU (架構代號為 Skylake),提供比先前 NSS-HA 解決方案更高的整體系統效能。此博客介紹此最新版本的 NSS 解決方案的 I/O 性能測試結果。
圖 1 顯示了 NSS7.3-HA 配置的設計。NSS7.3-HA 與其上一代 NSS7.2-HA 的主要區別如下:
  • 後端儲存陣列:
    • NSS7.2-HA:PowerVault MD3460 + 選配的 MD3060e (60 或 120 個 HDD)
    • NSS7.3-HA:PowerVault ME4084 (84 顆硬碟)
  • 作業系統:
    • NSS7.2-HA:RHEL 7.4
    • NSS7.3-HA:Red Hat® Enterprise Linux® 7.5
除了必要的軟體和韌體更新等項目外,NSS7.2-HA 和 NSS7.3-HA 共用相同的 HA 叢集設計和基本儲存組態。(有關配置的更多詳細資訊,請參閱 NSS7.0-HA 白皮書
NSS7.2-HA 和 NSS7.3-HA 的另一個重大改善是最大容量大幅增加。雖然 NSS7.2-HA 受到 Red Hat XFS 目前 500 TB 的支援限制,但在我們實驗室進行大量測試和驗證後,Dell EMC 與 Red Hat 達成合作協議,支援 NSS7.3-HA 組態,可用空間最大可達 768 TB。這是裝滿 12 TB 硬碟或 1008 TB 原始儲存空間的 Dell EMC PowerVault ME4084。

戰國策高架構

圖 1 顯示了虛線矩形內的 NSS 7.3 架構,嵌入在包括用戶端和公共網路交換機在內的典型測試台中。

圖 1.NSS7.3-HA 1008 TB 光空間 (768 TB 可用) 架構和試驗台

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下表總結了新 NSS HA 7.3 解決方案的不同元件。
  

表 1.NSS7.2-HA 和 NSS7.3-HA 的元件
 

NSS7.2-HA 版本 (2018 年 4 月)
「PowerEdge 第 14 代伺服器和 MD3460 + MD3060e」

NSS7.3-HA 版本 (2018 年 10 月)
「PowerEdge 第 14 代伺服器和 ME4084 型解決方案」

軟體

Red Hat Enterprise Linux 7.4,
核心 3.10.0-693.el7.x86_64

Red Hat 可擴充檔案系統 (XFS) v4.5.0-12

Red Hat Enterprise Linux 7.5,
核心 3.10.0-862.el7.x86_64

Red Hat 可擴充檔案系統 (XFS) v4.5.0-15

NFS 伺服器

兩台 Dell PowerEdge R740 伺服器。
CPU:雙 Intel Xeon Gold 6136 @ 3.0 GHz,每顆處理器 12 個核心。
記憶體:12 條 16GiB 2666 MT/秒 RDIMM。

外部網路連線能力

EDR、InfiniBand、10 GbE 或 Intel Omni-Path。

在此部落格中,請參閱 Mellanox ConnectX-4 IB EDR/100 GbE。
對於訂單,CX-5 IB EDR/100 GbE。

內部連線能力

Gigabit 乙太網路, 交換器 Dell Networking S3048-ON

OFED 版本

Mellanox OFED 4.3-1.0.1.0

Mellanox OFED 4.4-1.0.0

直接儲存連線

12 Gbps SAS 連線。

儲存子系統

Dell EMC MD3460 + 選配的 MD3060e。

60 – 120 – 3.5“ NL SAS 4 TB 磁碟機。
兩種組態:240 或 480 TB (光空間)。
6 或 12 個 LUN,8+2 RAID 6,區段大小 512KiB
無備援

Dell EMC PowerVault ME4084。

84 個 3.5“ NL SAS 磁碟機,最大 12 TB。
一種組態:最大 1008 TB (原始空間)。
8 個 LUN,線性 8+2 RAID 6,區塊大小 128KiB。
4 個通用 HDD 備件。

 


全新 PowerVault ME4084 儲存裝置繼續使用線性 8+2 RAID 6 作為基本建置單元,並採用 128 KiB 的新區塊大小 (區段大小),並選取「stripe 大小」的預先讀取值,以獲得最佳效能。此外,由於我們現在有 84 個磁碟機,因此我們有 8 個以 RAID 6 為基礎的 LUN 和 4 個全域備援 HDD,可立即更換任何故障的磁碟。這表示此解決方案的可用空間最大可達 768 TB。

NSS7.3-HA I/O 效能

此部落格介紹目前 NSS-HA 解決方案 (即 NSS7.3) 的 I/O 效能測試結果。所有效能測試均在 HA 無故障情境中執行,以衡量解決方案的最大功能。測試側重於三種類型的 I/O 模式:大型順序讀取和寫入、小型隨機讀取和寫入以及三種元數據操作(檔案創建、統計和刪除)。
使用 32 節點的運算叢集來產生效能指標測試的工作負荷。用戶端和 1008 TB (原始儲存大小) NSS 組態使用 InfiniBand EDR 和透過 IPoIB 掛接的檔案系統進行連線。每個 I/O 基準測試都在一系列用戶端上運行,以測試解決方案的可伸縮性。下表列出了有關所用用戶端的詳細資訊。

表 2.用戶端組態 (效能測試)
伺服器機型 PowerEdge C6420
伺服器數量 32 個伺服器叢集
CPU Intel(R) Xeon(R) Gold 6148 CPU @ 2.40 GHz
RAM 192 GiB
作業系統 Red Hat Enterprise Linux Server 7.4 版
核心 3.10.0-693.17.1.el7.x86_64
網路卡 Mellanox ConnectX-4 VPI IB EDR/100 GbE 單埠 QSFP28
OFED 版本 MLNX_OFED-4.3.1.0.1.0

 


本研究使用 IOzone MDtest 效能指標。IOzone 用於順序和隨機測試。對於順序測試,使用的請求大小為 1024 KiB。傳輸的資料總量為 256 GiB,以確保 NFS 伺服器快取已飽和。隨機測試使用 4 KiB 要求大小,每個用戶端讀取和寫入 4 GiB 檔。中繼資料測試是使用 MDtest 效能指標與 OpenMPI 執行,並包含檔案建立、統計和移除作業。(有關測試中使用的完整命令,請參閱 NSS7.0-HA 白皮書 的附錄 A。

IPoIB 循序寫入和讀取

圖 2 和圖 3 顯示順序寫入和讀取效能。由於測試群集有 32 個節點,因此 64 個線程數據點是使用 32 個用戶端獲取的,每個用戶端運行 2 個線程。
對於 NSS7.3-HA,峰值讀取性能為 7 GB/秒,峰值寫入性能幾乎為 5 GB/秒。從這兩個數位可以明顯看出,目前的 NSS7.3-HA 解決方案的順序效能數字高於先前的版本。讀取性能提高了 18.7%,但寫入性能尤其好,性能是前一個解決方案的 2.65 倍(在 16 個線程時)。比較峰值性能值,NSS7.3-HA 上的寫入速度提高了 2.13 倍,讀取速度提高了
12.5%。這部分是由於所有 PowerVault ME4084 內部元件 (包括 HDD 的 PowerVault MD3460 為 6 Gbps) 的 SAS 內部速度較高,達到 12 Gbps,允許每個 LUN 更高的輸送量,同時也因為新的儲存控制器可以比上一代 PowerVault MD3 更快地處理資訊。

圖 2.IPoIB 大型循序寫入效能

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圖 3.IPoIB 大型循序讀取效能

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IPoIB 隨機寫入和讀取

圖 4 和圖 5 顯示了隨機寫入和讀取的性能。
從圖中可以看出,隨機寫入可在 32 個執行緒達到尖峰效能,而先前版本的解決方案則在 64 個執行緒達到尖峰效能。隨機讀取性能在 NSS7.3 上穩步提高,最多 32 個用戶端,對於以前的解決方案,峰值為 16 個用戶端。新儲存裝置再次展現出優於上一代的效能,寫入效能提升高達 3.44 倍 (2 個執行緒),讀取效能 (32 個執行緒) 較上一代高出 85%。比較峰值效能時,隨機寫入的差異約為 13%,隨機讀取的差異約為 85%。這些改善主要歸功於全新 PowerVault ME4084 控制器,相較於 PowerVault MD3460 控制器,其處理能力更快。

圖 4。IPoIB 隨機寫入效能

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圖 5。IPoIB 隨機讀取效能

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IPoIB 中繼資料作業

圖 6、圖 7 和圖 8 分別顯示了檔案創建、統計和刪除操作的結果。由於 HPC 計算群集只有 32 個計算節點,因此在下圖中,每個用戶端最多執行一個線程,用戶端計數最多為 32,線程計數為 64、128、256 和 512,每個用戶端同時執行 2、4、8 或 16 個操作(線程)。
對於文件創建,與以前的解決方案相比,新解決方案在 32 個用戶端上顯示出大約兩倍的性能持續改進,峰值差異 (208%),然後略有下降,但即使比較兩個解決方案在 256 個線程下的峰值性能,新解決方案的速度也快
了 30%。新存儲對 Stat 操作的改進最大,其改進程度高達 7.7 倍,為 256 個線程,與峰值性能相比,NSS7.3 顯示的每秒統計操作數幾乎是以前版本的 NSS 的 6 倍。
最後,刪除操作的改進相對較小,大多數數據點的性能比以前的解決方案高出 33%或更好;除了 128 個線程的性能提高了 2.21 倍。在尖峰效能時,新儲存裝置的效能比先前的 NSS 系統
高出近 55%。所有這些改善都歸功於使用 SAS3 速度 (12 Gbps) 的更快 HDD,以及能夠實現更高 IOPS 和頻寬的全新 PowerVault ME4084 控制器。

圖 6。IPoIB 檔案建立效能


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圖 7。IPoIB 檔案統計效能

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圖 8。IPoIB 檔案移除效能

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結論和未來工作

在解決方案的不同代次中,NSS-HA 解決方案經歷了許多硬體和軟體更新,以不斷提供高可用性、更高的性能和更大的儲存容量。在所有這些版本中,戰國策HA解決方案系列的核心架構設計保持不變。為了顯示 NSS7.3-HA 與先前版本 (NSS7.2-HA) 之間的效能差異,對比了兩種解決方案的效能數字,顯示基於 PowerVault ME4084 的最新解決方案版本之卓越效能: 

対象製品

High Performance Computing Solution Resources, Dell EMC PowerVault ME4084
文書のプロパティ
文書番号: 000133483
文書の種類: Solution
最終更新: 21 2月 2021
バージョン:  3
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