Skip to main content
  • Place orders quickly and easily
  • View orders and track your shipping status
  • Create and access a list of your products
  • Manage your Dell EMC sites, products, and product-level contacts using Company Administration.

Wprowadzanie głębokiego uczenia na dużą skalę w obrazowaniu medycznym

Summary: HPC, systemy obliczeniowe o wysokiej wydajności, laboratorium innowacji HPC i AI, zestaw narzędzi NIVIDIA Clara, sztuczna inteligencja, obrazowanie medyczne

This article may have been automatically translated. If you have any feedback regarding its quality, please let us know using the form at the bottom of this page.

Article Content


Symptoms

Artykuł napisany przez Johna Lockmana i Rakshitha Vasudeva z zespołu firmy Dell w laboratorium innowacji HPC i AI firmy Dell EMC w lipcu 2019 r.

Cause

Wprowadzanie głębokiego uczenia na dużą skalę w obrazowaniu medycznym

Resolution

Wiersz opisu: 

Nowy zestaw narzędzi NVIDIA Clara AI Toolkit umożliwia programistom tworzenie i wdrażanie aplikacji do obrazowania medycznego w celu tworzenia inteligentnych instrumentów i zautomatyzowanych przepływów pracy w opiece zdrowotnej.

W dzisiejszych szpitalach technicy obrazowania medycznego ścigają się, aby nadążyć za obciążeniem wynikającym z rosnącego wykorzystania tomografii komputerowej, rezonansu magnetycznego i innych obrazów wykorzystywanych w procesach diagnostycznych. W dużym systemie szpitalnym stosunkowo niewielka liczba techników może być teraz narażona na setki, a nawet tysiące skanów w ciągu jednego dnia. Aby nadążyć za objętością, ci przepracowani technicy potrzebują narzędzi, które pomogą w procesie analizy złożonych obrazów, identyfikowania trudnych do wykrycia nieprawidłowości i wykrywania wskaźników choroby.

Coraz częściej instytucje medyczne poszukują sztucznej inteligencji, aby zaspokoić te potrzeby. Dzięki technologiom głębokiego uczenia systemy sztucznej inteligencji można teraz wyszkolić, aby służyły jako asystenci cyfrowi, którzy przejmują część ciężkiej pracy związanej z przepływami pracy związanymi z obrazowaniem medycznym. Nie chodzi o wykorzystanie sztucznej inteligencji do zastąpienia wyszkolonych specjalistów. Chodzi o wykorzystanie sztucznej inteligencji do usprawnienia przepływów pracy, zwiększenia wydajności i pomocy procesowym w identyfikacji spraw, które wymagają ich natychmiastowej uwagi. Dział IT szpitala musi opracować strategię, aby przygotować infrastrukturę do obsługi sztucznej inteligencji. Firmy NVIDIA i American College of Radiology nawiązały współpracę, aby umożliwić tysiącom radiologów tworzenie i wykorzystywanie sztucznej inteligencji w ich własnych placówkach, w oparciu o ich własne dane, w rozległej sieci tysięcy szpitali.

Jednym z takich zestawów narzędzi opartych na sztucznej inteligencji jest NVIDIA Clara AI, otwarta, skalowalna platforma obliczeniowa, która umożliwia tworzenie aplikacji do obrazowania medycznego w hybrydowych (wbudowanych, lokalnych lub chmurowych) środowiskach obliczeniowych. Dzięki funkcjom sztucznej inteligencji NVIDIA Clara szpitale mogą tworzyć inteligentne urządzenia i automatyzować przepływy pracy w sektorze opieki zdrowotnej.

Zestaw narzędzi Clara AI

Aby pomóc organizacjom we wdrożeniu sztucznej inteligencji Clara, firma NVIDIA oferuje pakiet Clara Deploy SDK. Ten zestaw narzędzi programistycznych Helm obejmuje kolekcję kontenerów NVIDIA GPU Cloud (NGC), które współpracują ze sobą w celu zapewnienia kompleksowego przepływu pracy przetwarzania obrazów medycznych na platformie Kubernetes. Obrazy kontenerów NGC są zoptymalizowane pod kątem systemów z akceleracją GPU NGC Ready, takich jak Dell EMC PowerEdge™ C4140 i Dell EMC PowerEdge™ R740xd.

Kontenery Clara AI obejmują akcelerowane przez GPU biblioteki do obliczeń, grafiki i sztucznej inteligencji; przykładowe zastosowania do przetwarzania i renderowania obrazów; oraz obliczeniowe przepływy pracy dla danych z tomografii komputerowej, rezonansu magnetycznego i ultrasonografii. Funkcje te wykorzystują platformy Docker i Kubernetes do organizowania przepływów pracy związanych z obrazami medycznymi oraz łączenia się z systemami PACS (systemy archiwizacji i komunikacji obrazów) lub skalowania aplikacji instrumentów medycznych.
 
SLN317882_en_US__1c1
Rysunek 1. Architektura Clara AI Toolkit

Zestaw narzędzi Clara AI Toolkit obniża bariery w stosowaniu sztucznej inteligencji w przepływach pracy związanych z obrazowaniem medycznym. Clara AI Deploy SDK zawiera:

  • Interfejs pozyskiwania danych adaptera DICOM do komunikacji ze szpitalnym systemem PAC
  • Podstawowe usługi w zakresie orkiestracji zasobów i zarządzania nimi na potrzeby wdrażania i opracowywania przepływów pracy
  • Referencyjne aplikacje sztucznej inteligencji, które mogą być używane w niezmienionej postaci z danymi zdefiniowanymi przez użytkownika lub mogą być modyfikowane za pomocą algorytmów sztucznej inteligencji zdefiniowanych przez użytkownika
  • Możliwości wizualizacji umożliwiające monitorowanie postępu i wyświetlanie wyników

Platformy serwerowe dla zestawu narzędzi

Organizacjom, które chcą wykorzystać sztuczną inteligencję NVIDIA Clara, firma Dell EMC oferuje solidne, akcelerowane przez procesory GPU platformy serwerowe, które obsługują zestaw narzędzi Clara AI Toolkit — serwer Dell EMC PowerEdge™ R740xd montowany w szafie serwerowej i serwer Dell EMC PowerEdge™ C4140 montowany w szafie serwerowej.

Serwer PowerEdge R740xd zapewnia równowagę między skalowalnością i wydajnością pamięci masowej. Dzięki obsłudze dysków NVMe i procesorów graficznych NVIDIA ta dwuprocesorowa platforma 2 U jest gotowa sprostać wymaganiom Clara AI i obciążeń związanych z obrazowaniem medycznym. Z kolei serwer PowerEdge C4140 to zoptymalizowany pod kątem akceleratora serwer o wysokości 1U montowany w szafie serwerowej, zaprojektowany z myślą o najbardziej wymagających obciążeniach roboczych. Dzięki obsłudze czterech procesorów graficznych ten dwuprocesorowy serwer o bardzo dużej gęstości został stworzony z myślą o wyzwaniach związanych z kognitywnymi obciążeniami roboczymi, w tym sztuczną inteligencją, uczeniem maszynowym i głębokim uczeniem.

W laboratorium innowacji HPC i AI w firmie Dell EMC zastosowaliśmy zestaw narzędzi Clara AI Toolkit z segmentacją narządów tomografii komputerowej i segmentacją wątroby przy użyciu tomografii komputerowej na naszych serwerach z akceleracją GPU z systemem Red Hat Enterprise Linux. Na potrzeby tych testów zebraliśmy dane z tomografii komputerowej jamy brzusznej, serię obrazów medycznych 2D, z NIH Cancer Image Archive https://www.cancerimagingarchive.net/. Wykorzystaliśmy narzędzia z zestawu narzędzi Clara AI Toolkit do wykonania przepływu pracy, który najpierw konwertuje serię DICOM do spożycia i identyfikuje poszczególne narządy na podstawie tomografii komputerowej (segmentacja narządów).

Następnie przepływ pracy może użyć tych podzielonych na segmenty narządów jako danych wejściowych do identyfikacji wszelkich nieprawidłowości. Po zakończeniu analizy system tworzy zarówno render objętości 3D z adnotacjami MetaIO, który można przeglądać na serwerze Clara Render Server, jak i pliki DICOM, które można porównywać obok siebie z przeglądarkami obrazów medycznych, takimi jak ORTHANC lub Oviyam2. Narzędzia zawarte w zestawie narzędzi Clara AI Toolkit zapewniają szybki start do użytku w środowiskach obrazowania medycznego, które chcą wykorzystać moc sztucznej inteligencji.
 

SLN317882_en_US__2c2
 
Rysunek 2. Oviyam2 Viewer demonstrujący widok obok siebie Clara AI Processed vs oryginalny tomograf komputerowy

Clara AI w pracy

Chociaż Clara AI jest stosunkowo nową ofertą, została wprowadzona na rynek w marcu, z ogólną dostępnością w czerwcu, platforma jest już używana w niektórych głównych instytucjach medycznych, w tym na Uniwersytecie Stanowym Ohio, Narodowym Instytucie Zdrowia i Uniwersytecie Kalifornijskim w San Francisco.

Naukowcy z National Institutes of Health Clinical Center i NVIDIA wykorzystali Clara AI do opracowania metody uogólniania domen do segmentacji prostaty z otaczającej tkanki w rezonansie magnetycznym. Na blogu firmy NVIDIA zauważono, że zlokalizowany model "osiągnął wydajność podobną do wydajności radiologa i przewyższył inne najnowocześniejsze algorytmy, które zostały wytrenowane i ocenione na danych z tej samej domeny".

Jak pokazują ci pierwsi użytkownicy, NVIDIA Clara AI to platforma, która może potencjalnie przynieść dużą wartość organizacjom, które chcą wykorzystać sztuczną inteligencję do umożliwienia głębokiego uczenia na dużą skalę w obrazowaniu medycznym.
 

SLN317882_en_US__3c3
 
Rysunek 3. Dolegliwości na segmentowanej wątrobie zidentyfikowane przez Clara AI Toolkit

Aby dowiedzieć się więcej

Aby dowiedzieć się więcej o możliwościach NVIDIA Clara, odwiedź następujące linki:

 

 

Article Properties


Affected Product

High Performance Computing Solution Resources, Poweredge C4140, PowerEdge R740XD

Last Published Date

29 Mar 2024

Version

5

Article Type

Solution