Article Number: 000136597
Laajan syväoppimisen ottaminen käyttöön lääkinnällisessä kuvannuksessa
Summary: HPC, suurteholaskenta, HPC ja AI Innovation Lab, NIVIDIA Clara Toolkit, tekoäly, lääketieteellinen kuvantaminen
Article Content
Symptoms
Cause
Resolution
Kuvausrivi:
Uuden NVIDIA Clara AI Toolkit -työkalun avulla kehittäjät voivat rakentaa ja ottaa käyttöön lääketieteellisiä kuvantamissovelluksia, joilla voidaan luoda älykkäitä instrumentteja ja automatisoituja terveydenhuollon työnkulkuja.
Nykypäivän sairaaloissa lääketieteelliset kuvantamisteknikot kilpailevat pysyäkseen mukana työmäärässä, joka johtuu CT-skannausten, MRI-skannausten ja muiden diagnostisissa prosesseissa käytettävien kuvantamisten kasvavasta käytöstä. Suuressa sairaalajärjestelmässä suhteellisen pieni määrä teknikkoja saattaa nyt joutua satojen tai jopa tuhansien skannausten kohteeksi yhden päivän aikana. Pysyäkseen volyymin tasalla nämä ylityöllistetyt teknikot tarvitsevat työkaluja, jotka auttavat monimutkaisten kuvien analysoinnissa, vaikeasti havaittavien poikkeavuuksien tunnistamisessa ja sairauden indikaattoreiden havaitsemisessa.
Lääketieteelliset laitokset odottavat yhä enemmän tekoälyä vastaamaan näihin tarpeisiin. Syväoppimistekniikoiden avulla tekoälyjärjestelmät voidaan nyt kouluttaa toimimaan digitaalisina avustajina, jotka ottavat vastaan osan lääketieteellisen kuvantamisen työnkulkujen raskaasta työstä. Kyse ei ole tekoälyn käyttämisestä koulutettujen ammattilaisten korvaamiseen. Kyse on tekoälyn käyttämisestä työnkulkujen virtaviivaistamiseen, tehokkuuden lisäämiseen ja kulkueiden auttamiseen tunnistamaan tapaukset, jotka vaativat välitöntä huomiota. Sairaaloiden IT-osaston on laadittava strategioita, jotta infrastruktuuri olisi tekoälyvalmis. NVIDIA ja American College of Radiology ovat tehneet yhteistyötä, jotta tuhannet radiologit voivat luoda ja käyttää tekoälyä omissa tiloissaan omien tietojensa avulla tuhansien sairaaloiden laajassa verkostossa.
Yksi näistä tekoälypohjaisista työkaluista on NVIDIA Clara AI, avoin, skaalautuva tietojenkäsittelyalusta, joka mahdollistaa lääketieteellisten kuvantamissovellusten kehittämisen hybridi-ympäristöihin (sulautetut, paikalliset tai pilvi) tietojenkäsittely-ympäristöihin. NVIDIA Clara AI -ohjelmiston avulla sairaalat voivat luoda älykkäitä instrumentteja ja automatisoituja terveydenhuollon työnkulkuja.
Clara AI -työkalupakki
NVIDIA auttaa organisaatioita hyödyntämään Clara AI:tä tarjoamalla Clara Deploy SDK:n. Tämä Helmiin pakattu ohjelmistokehityspaketti sisältää kokoelman NVIDIA GPU Cloud (NGC) - säilöjä , jotka yhdessä tarjoavat kattavan lääketieteellisen kuvankäsittelyn työnkulun Kubernetesissa. NGC-säilöjen näköistiedostot on optimoitu NGC Ready GPU -kiihdytettyjä järjestelmiä, kuten Dell EMC PowerEdge™ C4140 ja Dell EMC PowerEdge™ R740xd, varten.
Clara AI -säilöt sisältävät GPU-kiihdytettyjä kirjastoja laskentaan, grafiikkaan ja tekoälyyn; esimerkkisovellukset kuvankäsittelyyn ja renderointiin; ja laskennalliset työnkulut CT-, MRI- ja ultraäänitiedoille. Nämä ominaisuudet hyödyntävät Dockeria ja Kubernetesia lääketieteellisten kuvien työnkulkujen järjestämiseen ja yhteyden muodostamiseen PACS-järjestelmiin (kuvien arkistointi- ja viestintäjärjestelmiin) tai lääketieteellisten instrumenttien sovellusten skaalaamiseen.
Kuva 1. Clara AI Toolkit -arkkitehtuuri
Clara AI Toolkit madaltaa tekoälyn käyttöönoton esteitä lääketieteellisen kuvantamisen työnkuluissa. Clara AI Deploy SDK sisältää:
- DICOM-sovittimen tiedonsiirtorajapinta kommunikoimaan sairaalan PAC-järjestelmän kanssa
- Ydinpalvelut työnkulun käyttöönoton ja kehittämisen resurssien orkestrointiin ja hallintaan
- Viittaa AI-sovelluksiin, joita voidaan käyttää sellaisenaan käyttäjän määrittämien tietojen kanssa tai joita voidaan muokata käyttäjän määrittämillä tekoälyalgoritmeilla
- Visualisointiominaisuudet edistymisen seuraamiseksi ja tulosten tarkastelemiseksi
Toolkitin palvelinalustat
Organisaatioille, jotka haluavat hyödyntää NVIDIA Clara AI:tä, Dell EMC tarjoaa vankat, GPU-kiihdytetyt palvelinalustat, jotka tukevat Clara AI Toolkitiä – Dell EMC PowerEdge™ R740xd -kehikkopalvelinta ja Dell EMC PowerEdge™ C4140 -kehikkopalvelinta.
PowerEdge R740xd -palvelin tarjoaa tasapainon tallennuksen, skaalautuvuuden ja suorituskyvyn välillä. NVMe-asemia ja Nvidia-näytönohjaimia tukeva kaksikantainen 2U-alusta on valmis Claran tekoälyn ja lääketieteellisen kuvantamisen työkuormien vaatimuksiin. PowerEdge C4140 on puolestaan kiihdytinoptimoitu 1U-kehikkopalvelin, joka on suunniteltu vaativimpia työkuormia varten. Neljää grafiikkasuoritinta tukeva erittäin tiheä kaksikantainen palvelin on suunniteltu vastaamaan kognitiivisten kuormitusten, kuten tekoälyn, koneoppimisen ja syväoppimisen, haasteisiin.
Dell EMC:n HPC- ja tekoälyinnovaatiolaboratoriossa käytimme Clara AI Toolkitiä elinten CT-segmentoinnin ja maksan CT-segmentoinnin kanssa grafiikkasuoritinkiihdytetyissä palvelimissamme, joissa on Red Hat Enterprise Linux. Näitä testejä varten keräsimme vatsan CT-skannaustietoja, sarjan 2D-lääketieteellisiä kuvia, NIH Cancer Image Archive https://www.cancerimagingarchive.net/: stä. Käytimme Clara AI Toolkitin työkaluja suorittaaksemme työnkulun, joka muuntaa ensin DICOM-sarjan nieltäväksi ja tunnistaa yksittäiset elimet CT-skannauksesta (elinten segmentointi).
Seuraavaksi työnkulku voi käyttää näitä segmentoituja elimiä syötteenä mahdollisten poikkeavuuksien tunnistamiseksi. Kun analyysi on valmis, järjestelmä luo sekä MetaIO-merkityn 3D-äänenvoimakkuuden renderöinnin, jota voidaan tarkastella Clara Render Server -palvelimessa, että DICOM-tiedostoja, joita voidaan verrata vierekkäin lääketieteellisten kuvankatseluohjelmien, kuten ORTHANC: n tai Oviyam2: n, kanssa. Clara AI Toolkitin sisältämät työkalut tarjoavat varaslähdön käytettäväksi lääketieteellisissä kuvantamisympäristöissä, jotka haluavat hyödyntää tekoälyn tehoa.
Kuva 2: Oviyam2-katseluohjelma, jossa näkyy vierekkäin Clara AI Processed vs Original CT Scan
Clara AI työssään
Vaikka Clara AI on suhteellisen uusi tarjous, se lanseerattiin maaliskuussa, ja se on yleisesti saatavilla kesäkuussa, alusta on jo käytössä joissakin suurissa lääketieteellisissä laitoksissa, kuten Ohion osavaltion yliopistossa, kansallisissa terveyslaitoksissa ja Kalifornian yliopistossa San Franciscossa NVIDIA: n mukaan.
National Institutes of Health Clinical Center ja NVIDIA: n tutkijat käyttivät Clara AI: tä kehittääkseen verkkotunnuksen yleistysmenetelmän eturauhasen segmentoimiseksi ympäröivästä kudoksesta MRI: ssä. NVIDIA-blogissa todetaan, että lokalisoitu malli "saavutti samanlaisen suorituskyvyn kuin radiologi ja ylitti muut huipputekniset algoritmit, jotka koulutettiin ja arvioitiin saman verkkotunnuksen tietojen perusteella".
Kuten nämä varhaiset käyttöönottajat ovat osoittaneet, NVIDIA Clara AI on alusta, joka voi tuoda paljon arvoa organisaatioille, jotka haluavat hyödyntää tekoälyä laajamittaisen syväoppimisen mahdollistamiseksi lääketieteellisessä kuvantamisessa.
Kuva 3: Clara AI Toolkitin tunnistamat segmentoidun maksan sairaudet
Lisätietoja
Voit tutustua NVIDIA Claran ominaisuuksiin tarkemmin seuraavista linkeistä:
- Clara AI Toolkit -lataussivu:
- Teknisen kehittäjän blogi
- Kehittäjän uutiset:
- NVIDIA Clara -alusta.
Article Properties
Affected Product
High Performance Computing Solution Resources, Poweredge C4140, PowerEdge R740XD
Last Published Date
29 Mar 2024
Version
5
Article Type
Solution